Variabilidade, seleção e associação genômica ampla para características de produção em café conilon

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dc.contributor.advisor-co1Ferreira, Marcia Flores da Silva
dc.contributor.advisor-co1IDhttps://orcid.org/0000-0003-1541-6634
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5719813884063445
dc.contributor.advisor-co2Oliveira, Lidiane dos Santos Gomes
dc.contributor.advisor-co2IDhttps://orcid.org/0000-0003-1245-7633
dc.contributor.advisor-co2Latteshttp://lattes.cnpq.br/8764402842768778
dc.contributor.advisor-co3Bernardes, Carolina de Oliveira
dc.contributor.advisor1Feirreira, Adésio
dc.contributor.advisor1IDhttps://orcid.org/0000-0002-7000-1725
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/5400370038397801
dc.contributor.authorCouto, Diego Pereira do
dc.contributor.authorIDhttps://orcid.org/0000-0002-5660-7413
dc.contributor.authorLatteshttp://lattes.cnpq.br/4518653765839020
dc.contributor.referee1Zaidan, Iasmine Ramos
dc.contributor.referee1IDhttps://orcid.org/0000-0001-9115-4504
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/1730496208019615
dc.contributor.referee2Souza, Elaine Manelli Riva
dc.contributor.referee2IDhttps://orcid.org/0009-0000-2067-8220
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/2280132329500638
dc.contributor.referee3Amaral Júnior, Antônio Teixeira do
dc.contributor.referee3IDhttps://orcid.org/0000-0003-4831-7878
dc.contributor.referee3Latteshttp://lattes.cnpq.br/5063486824345109
dc.contributor.referee4Senra, João Felipe de Brites
dc.contributor.referee4IDhttps://orcid.org/0000-0001-7915-2821
dc.contributor.referee4Latteshttp://lattes.cnpq.br/2268398576674753
dc.date.accessioned2025-11-10T10:08:56Z
dc.date.available2025-11-10T10:08:56Z
dc.date.issued2025-03-12
dc.description.abstractO Brasil é importante produtor global de Coffea canephora e o estado do Espírito Santo é o maior produtor nacional entregando cerca de 70% do total produzido no país. Este estudo avaliou 441 genótipos ao longo de dois anos, combinando análises fenotípicas e genômicas com o objetivo de realizar a seleção genômica e identificar associações genômicas amplas para características de produção em café conilon, a fim de contribuir para o desenvolvimento sustentável da cafeicultura, melhorar a produtividade dos genótipos dessa variedade e, assim, fortalecer a economia agrícola. Dentre estes genótipos 436 são de origem seminal e cinco são clones comerciais (A1, RO, P2, Verdin e RBS). As sementes foram coletadas de lavouras antigas no sul do Espírito Santo nos municípios de Alegre, Jerônimo Monteiro, Muqui, Mimoso do Sul e São Jose do Calçado. A fenotipagem foi realizada para sete características de produção, por dois anos, em um experimento no município de Mimoso do Sul, enquanto a genotipagem, baseada no método DArTseq™, permitiu a identificação de SNPs. O experimento foi implantado em 2018 em delineamento de Blocos Aumentados de Federer. Modelos mistos via REML/BLUP foram utilizados para estimar parâmetros genéticos, prever valores genotípicos e explorar a variabilidade. A análise de associação genômica ampla (GWAS) identificou 385 SNPs significativamente associados as características produtivas, sendo que 283 estavam inseridos ou próximos a genes candidatos. Esses SNPs revelaram relações com o desenvolvimento da planta e respostas a estresses, evidenciando o potencial da seleção assistida por marcadores nos programas de melhoramento do cafeeiro. A aplicação da Seleção Genômica Ampla (GWS) confirmou a eficiência da predição genômica na seleção de genótipos produtivos. Características como comprimento de ramos plagiotrópicos e peso de cem grãos apresentaram alta herdabilidade, garantindo maior precisão na seleção. Os genótipos 173.7.5, G114.5, G114.4 e G133.3 destacaram-se com ganhos expressivos, superando clones comerciais. Assim, a integração de análises fenotípicas e genômicas reforça o potencial das ferramentas (GWS e GWAS) para acelerar o melhoramento do C. canephora, contribuindo para a obtenção de cultivares mais produtivas e adaptadas
dc.description.resumoO Brasil é importante produtor global de Coffea canephora e o estado do Espírito Santo é o maior produtor nacional entregando cerca de 70% do total produzido no país. Este estudo avaliou 441 genótipos ao longo de dois anos, combinando análises fenotípicas e genômicas com o objetivo de realizar a seleção genômica e identificar associações genômicas amplas para características de produção em café conilon, a fim de contribuir para o desenvolvimento sustentável da cafeicultura, melhorar a produtividade dos genótipos dessa variedade e, assim, fortalecer a economia agrícola. Dentre estes genótipos 436 são de origem seminal e cinco são clones comerciais (A1, RO, P2, Verdin e RBS). As sementes foram coletadas de lavouras antigas no sul do Espírito Santo nos municípios de Alegre, Jerônimo Monteiro, Muqui, Mimoso do Sul e São Jose do Calçado. A fenotipagem foi realizada para sete características de produção, por dois anos, em um experimento no município de Mimoso do Sul, enquanto a genotipagem, baseada no método DArTseq™, permitiu a identificação de SNPs. O experimento foi implantado em 2018 em delineamento de Blocos Aumentados de Federer. Modelos mistos via REML/BLUP foram utilizados para estimar parâmetros genéticos, prever valores genotípicos e explorar a variabilidade. A análise de associação genômica ampla (GWAS) identificou 385 SNPs significativamente associados as características produtivas, sendo que 283 estavam inseridos ou próximos a genes candidatos. Esses SNPs revelaram relações com o desenvolvimento da planta e respostas a estresses, evidenciando o potencial da seleção assistida por marcadores nos programas de melhoramento do cafeeiro. A aplicação da Seleção Genômica Ampla (GWS) confirmou a eficiência da predição genômica na seleção de genótipos produtivos. Características como comprimento de ramos plagiotrópicos e peso de cem grãos apresentaram alta herdabilidade, garantindo maior precisão na seleção. Os genótipos 173.7.5, G114.5, G114.4 e G133.3 destacaram-se com ganhos expressivos, superando clones comerciais. Assim, a integração de análises fenotípicas e genômicas reforça o potencial das ferramentas (GWS e GWAS) para acelerar o melhoramento do C. canephora, contribuindo para a obtenção de cultivares mais produtivas e adaptadas.
dc.formatText
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufes.br/handle/10/20596
dc.languagepor
dc.language.isopt
dc.publisherUniversidade Federal do Espírito Santo
dc.publisher.countryBR
dc.publisher.courseDoutorado em Genética e Melhoramento
dc.publisher.departmentCentro de Ciências Agrárias e Engenharias
dc.publisher.initialsUFES
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento
dc.rightsopen access
dc.subjectCoffea canephora
dc.subjectSNPs
dc.subjectMelhoramento genético
dc.subjectGenes candidatos
dc.subject.cnpqMelhoramento Vegetal
dc.titleVariabilidade, seleção e associação genômica ampla para características de produção em café conilon
dc.typedoctoralThesis
foaf.mboxemail@ufes.br
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